El cómo se doblan las proteínas parece un extraño problema. Todo tiene que ver sobre cómo el ADN pone una secuencia de aminoácidos para que al juntarlos construyan una proteína, aunque todo esto está determinado por su orden. Una vez que la cadena proteica se ha formado se crea una estructura tridimensional que se parece a una pieza de cable que antes ha sido ya doblado y que “recuerda” la forma que tenía. La manera en que la proteína crea una imagen 3D se determina de una manera por demás compleja y bajo la influencia de la atracción de los diferentes aminoácidos. Los giros de la proteína en el espacio hacen que ciertos aminoácidos se atraigan fuertemente, minimizando el doblaje local de la estructura.
FOTO: Captan a dos estrellas chocando en algún lugar del Universo
Por ello, si se tiene una cadena de aminoácidos, dada una secuencia de ADN, esto da una fórmula química de la proteína pero no su estructura tridimensional. El trabajar sobre esta forma 3D es el problema de doblaje de la proteína y es muy difícil. Y probablemente el entender esto lleve a una serie de aplicaciones, por ejemplo, en nuevos medicamentos, por lo cual esto lo hace un problema interesante e importante.

Los procedimientos de las optimizaciones convencionales son muy lentos y es entonces donde las redes neuronales pueden ayudar. DeepMind se unió a una competencia para predecir el doblaje de las proteínas usando un programa que llamó AlphaFold, que es una red neuronal. Los resultados sobrepasan …