Bienvenido al mundo real, Neo.– Morfeo

Thomas Anderson ha estado llevando una doble vida. Durante el día es programador en una empresa. Pero por la noche es Neo, un hacker de élite en continua búsqueda de algo. A través de Morfeo descubre que el mundo que él conoce es en realidad Matrix, una realidad artificial creada en la mente de las personas; una simulación de cómo era el mundo unos doscientos años atrás, en 1999. Y que el mundo real está sometido al dominio de máquinas inteligentes que utilizan a los humanos como pilas de combustible mientras los mantienen a raya haciéndoles soñar que viven una vida normal.

Pero en ese mundo real también hay personas «despiertas» que viven desenchufadas de Matrix y que oponen resistencia al poder de las máquinas. Morfeo encabeza un grupo de resistencia que entre otras cosas selecciona y «desenchufa» de Matrix a potenciales reclutas para la lucha. Morfeo cree haber encontrado en Neo a «El Elegido» cuya llegada había profetizado el Oráculo como «aquel que destruirá Matrix, pondrá final a la guerra y liberará a la humanidad.»

Los grupos de resistencia pueden entrar y salir a (más o menos) su antojo de Matrix en forma de hackeos a través de las líneas telefónicas. Allí son perseguidos por Agentes cuya misión es detectarlos y destruirlos. En el mundo real también ofrecen resistencia la lucha contra las máquinas que buscan Sion, la última ciudad humana y cuya caída supondría el fin de la resistencia y de los …