Para salvar a la humanidad y al NetherRealm, no será suficiente el reunir a los peleadores más fuertes de ambas dimensiones. En Mortal Kombat 11 también será necesario invocar a guerreros de diferentes épocas de la línea temporal de la serie para enfrentar a Kronika, quien domina el tiempo y será la villana principal de la campaña del juego.